Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms