Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDRF1Q3B7T1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms