Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms