Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCBQ16585 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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