Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms