Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ZFHX3Q15911 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ZFHX3Q15911 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ZFHX3Q15911 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ZFHX3Q15911 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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