Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN9AQ15858 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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