Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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