Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3GAP1Q15042 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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