Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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