Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PLD1Q13393 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms