Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCGQ13326 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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