Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK3Q13003 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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