Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms