Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms