Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms