Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOP2BQ02880 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2BQ02880 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms