Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms