Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms