Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms