Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms