Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP2P81877 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms