Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCS1P62166 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms