Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms