Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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