Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCR4P51679 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCR4P51679 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms