Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP4P49662 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms