Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NESP48681 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NESP48681 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NESP48681 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NESP48681 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NESP48681 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NESP48681 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NESP48681 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NESP48681 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NESP48681 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NESP48681 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NESP48681 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NESP48681 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NESP48681 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NESP48681 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NESP48681 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NESP48681 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NESP48681 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NESP48681 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NESP48681 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NESP48681 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NESP48681 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NESP48681 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NESP48681 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NESP48681 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NESP48681 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NESP48681 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NESP48681 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NESP48681 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NESP48681 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
NESP48681 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms