Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms