Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP3P42574 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP3P42574 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP3P42574 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms