Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLH1P40692 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLH1P40692 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms