Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms