Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms