Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms