Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms