Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPREP23469 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPREP23469 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPREP23469 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPREP23469 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPREP23469 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms