Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms