Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFAP15692 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms