Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL6A2P12110 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL6A2P12110 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL6A2P12110 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL6A2P12110 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL6A2P12110 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms