Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms