Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGB3P0DN86 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms