Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBA3O96018 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA3O96018 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APBA3O96018 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APBA3O96018 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA3O96018 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA3O96018 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA3O96018 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA3O96018 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA3O96018 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA3O96018 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA3O96018 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA3O96018 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA3O96018 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA3O96018 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms