Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRATO95237 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRATO95237 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRATO95237 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRATO95237 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRATO95237 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRATO95237 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRATO95237 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRATO95237 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRATO95237 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRATO95237 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRATO95237 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRATO95237 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRATO95237 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms