Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CIAO1O76071 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms