Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms