Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KA4O75676 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms