Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ABCC9O60706 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC39.51■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ABCC9O60706 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms