Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEFVO15553 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MEFVO15553 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MEFVO15553 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MEFVO15553 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MEFVO15553 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MEFVO15553 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MEFVO15553 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MEFVO15553 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms