Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00473A8K010 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00473A8K010 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms