Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms